全球首个!!!编码共有新生抗原的 “off-the-shelf” MSI肿瘤疫苗

文章来源: 新生抗原NeoAG 于2020-07-31 16:11:04发布 新闻转自各大新闻媒体,新闻内容并不代表本网立场!如有侵权请联系管理员删除!

微卫星不稳定性(Microsatellite Instability,MSI),是指由于在DNA复制时插入或缺失突变引起的微卫星(Microsatellite, MS)序列长度改变的现象,常由错配修复功能(Mismatch repair, MMR)缺陷引起。MS序列,是一些短而重复的DNA序列,一般由1~6个核苷酸组成,串联重复排列,常见类型为双碱基CA/GA/GT或单碱基A/T等。MS序列可以位于基因的重要非编码区,也可以位于基因的编码区,多态性分布于整个基因组,个体差异大。

  MSI现象于1993年被Jacobs等人在直肠癌中首次发现。随着针对MSI的研究深入,发现MSI现象不止存在于直肠癌,在子宫内膜癌、胃癌、肝细胞癌、乳腺癌等实体瘤中均有发生。2019年8月,国家药品监督管理局医疗器械技术审评中心在官网上发布了“微卫星不稳定性(MSI)检测概述”,

 


指出临床研究证实,MSI与直肠癌的预后有着密切的关系。MSI-H直肠癌患者相比MSS患者具有显著的生存优势,临床表现较差,但预后更好。研究证实,针对Ⅱ/Ⅲ期直肠癌患者,MSI-H患者的总生存期及无病生存期明显延长。美国国家综合癌症网络(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)发布的直肠癌指南,建议MSI检测应在所有直肠癌史的病人中进行。
 

  此外,MSI在指导用药领域也进展颇多。
 

  目前美国FDA已批准PD-1免疫治疗单抗pembrolizumab、ipilimumab和nivolumab用于具有错配修复缺陷(dMMR)/MSI-H表型的转移性直肠癌(mCRC)的末线治疗。除了mCRC的治疗外,2017年5月,美国FDA批准了PD-1抗体pembrolizumab用于治疗成人和儿童具有dMMR/MSI-H表型的没有其他治疗选择的,不可切除或转移性实体瘤患者。
 

  《中国直肠癌诊疗指南》(2010版)就明确了“Ⅱ期直肠癌,有条件者建议检测组织标本MMR或MSI,如为dMMR或MSI-H,不推荐氟尿嘧啶类药物的单药辅助化疗”。在《中国直肠癌诊疗指南》(2017版)的组织病理学检查部分,增加了MMR或MSI的检测作为复发或转移性直肠癌的推荐检测方法,“确定为复发或转移性直肠癌时,推荐检测肿瘤组织K-ras及N-ras基因、BRAF基因、错配修复蛋白表达或微卫星状态及其他相关基因状态以指导进一步治疗。”
 

  7月21日,NCI的科学家联合Nouscom AG的研究人员发表了一篇名为“A genetic vaccine encoding shared cancer neoantigens to treat tumors with Microsatellite Instability (一种编码共有新生抗原的MSI肿瘤疫苗)”的文章(公众号内回复“20200730”获取原文献)指出,TCGA数据库中,98%的MSI的CRC肿瘤共有超过400aa。
 

  因此在这个研究中,研究人员开发了一种用于治疗MSI肿瘤的新生抗原疫苗。他们认为,与错配修复缺陷(dMMR)和微卫星不稳定性(MSI)相关的肿瘤会积累插入/缺失突变(indels),这些突变可预测,因为它们主要出现在单核苷酸重复序列上。编码区中的这些插入缺失突变导致翻译移位,产生移码肽(FSP)。FSP具有高度免疫原性,可以安全地用于疫苗中,因为它们与人蛋白质组中发现的天然蛋白质序列没有相似之处。因此,它们是理想的肿瘤特异性新生抗原。通过分析来自TCGA数据库中320个MSI肿瘤活检组织和健康组织的遗传序列,以选择共有的FSP。再筛选出209种FSP,

209种 FSP的筛选流程

 

并将其克隆到非人类大猿腺病毒和经修饰的安卡拉痘苗载体中,以生成称为“Nous-209”的病毒载体疫苗。Nous-209是一种“off-the-shelf(现成的)”癌症疫苗,编码许多共有新生抗原,能够有效预防肿瘤复发。然后,他们对20名MSI大肠癌患者的肿瘤活检组织进行测序发现,每一位肿瘤活检中提取的DNA和mRNA中,能检测到31个FSP

 

Validation in MSI patients

 

Ex vivo 小鼠的免疫原性和In Vitro 免疫原性验证实验在FSP特异性CD+8和CD4+T细胞中也引起了有效和广泛的应答。研究人员对分离的小鼠脾细胞进行IFN-γELIS pot检测。他们使用了16个多肽池(P1-P16),用以覆盖整个疫苗序列。ELISpot数据以IFN-γ每百万脾细胞的斑点形成细胞(SFCs)表示,阳性判定:

(I)在ConA刺激井中存在IFN-γ;

(Ii)阳性的斑点数井是对照组(DMSO)中检测到的数量的三倍;

(III)至少有30个特异性斑点/百万个脾细胞;

 

根据其官网显示,Nous-209预计将在2019年Q4进入临床I期研究,届时,它将成为全球首个进入临床研究的“off-the-shelf”共有新生抗原疫苗。

 

 

Nous-209疫苗示意图 :GAd-209-FSP+MVA-209-FSP
 
209个FSP被组装成4个人造基因片段,将4个GAD和4个MVA载体混合到分别产生多价GAD-209-FSP和MVA-209-FSP疫苗统称为Nous-209。 每个格子表示不同的FSP。

 

 
参考文献:
1.《微卫星不稳定性(MSI)检测概述》,国家药品监督管理局医疗器械技术审评中心,临床与生物统计二部 方丽等。
2.Cancer Res Published OnlineFirst July 20, 2020.Guido Leoni, Anna Morena D'Alise, Gabriella Cotugno, et al. treat tumors with Microsatellite Instability. Cancer Res Published OnlineFirst July 20, 2020.
3.http://www.nouscom.com/pipeline/


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