根据彭博资讯报道，先前已有研究表明人类大便中上万亿的微生物和开发癌症免疫疗法是有关联的，而如今，至少有 5 - 6 个初创生物科技公司正在参与将这种基础科学转化为实际治疗药物的竞争中，同时有两家大型制药公司（默克、阿斯利康）也在积极进行肠道微生物研究，并计划在明年将相应疗法应用到患者。

这些公司已经创建了微生物组研究中心，争取可以找到规避现有免疫疗法副反应的肠道细菌性疗法。 利用人下消化道细菌进行疗法开发，其适应症范围将是非常广泛的，这也意味着制药公司可以因此获得更大收益。

最近几年，科学家已经发现了身体中的微生物在人体生物学和人类疾病方面扮演着关键的作用，这种关联性的研究最初发表在 2015 年的研究论文中，其中一篇在小鼠中研究了接受免疫治疗药物治疗的患者的排泄物是如何增强药物有效性的；其他的报道则表明了某些细菌联合一种免疫药物可以让肿瘤停止生长。

微生物生态系统研究领域，研究人员需要达到三个关键目标。其中之一是确定哪些患者可以更好的从这些疗法中获益；其二是如何去扭转人类的免疫系统以让接受治疗的患者对这些疗法产生应答；最后是需要避免免疫系统对肠道攻击所带来的常见副反应。当然，长远的目标则是利用肠道细菌发现可以治疗甚至预防癌症的对应疗法。

但是，像其他疗法一样，将动物模型中的试验结果重现到人类，将是具有很大挑战的。哪些细菌最为有效，口服给药和通过粪便移植哪类效果更好，目前这些都是不清楚的。现在最要紧的科学挑战是找到最佳生态系统，即有效、无副作用的细菌组合体。

目前，进行癌症微生物组疗法的较为前沿公司包括：Seres Therapeutics、Epiva Biosciences，以及利用微生物组开发溃疡性结肠炎相关炎症及疼痛治疗的辉瑞和罗氏参与投资的 Second Genome，该公司拥有微生物组发现平台。

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