支气管灌注和栓塞化疗的并发症除了一般血管穿刺术和化疗药物的并发症，最为严重的是脊髓损伤。发生原因：胸段脊髓90％血供来自肋间动脉，而肋间动脉与支气管动脉共干；插管后血管损伤狭窄或血栓形成，造成脊髓缺血；造影剂对脊髓的损伤，尤其是离子型造影剂；高浓度化疗药物对脊髓的损伤等。脊髓损伤临床表现为术后数小时脊髓横断损伤的症状，如损伤平面以下运动、感觉障碍以及尿潴留等。预防措施：插管要轻柔；尽量使用非离子型造影剂，离子型造影剂浓度应稀释到50％以下且量不宜多(10毫升以下)；化疗药物浓度要低，灌注要慢；注射过程中病人出现胸背部肌肉、皮肤烧灼样痛，应停止注射，并用肝素冲洗。脊髓损伤后处理措施有：给予激素、脱水剂、血管扩张药物和神经营养药物等，多数病人在2～8周内部分或完全恢复。